Aminokwasy
Z Wikipedii
Aminokwasy – organiczne związki chemiczne, zawierające grupę aminową -NH2 (zasadową) oraz grupę karboksylową -COOH (kwasową) lub – w ujęciu ogólniejszym – dowolną grupę kwasową, np. sulfonową. W roztworach aminokwasy występują jako tzw. sole wewnętrzne (amfolity). Niezwykle ważnym kryterium aminokwasów jest więc punkt izoelektryczny (pI)
Spis treści |
[edytuj] Kryteria podziału aminokwasów
Istnieje wiele kryteriów podziału aminokwasów:
- Rodzaj rodnika (łańcuchowe, pierścieniowe)
- Polarność rodnika (polarny, niepolarny)
- Miejsce syntezy (endogenne, egzogenne)
- Położenie grupy aminowej względem karboksylowej (α, β, γ, δ i ε-aminokwasy)
- Przemiany szkieletów:
- Glikogenne (dostarczają pirogronianu)
- Ketogenne (dostarczają Acetylo-CoA)
- Glikoketogenne
- Występowanie w białkach (proteogenne, nieproteogenne)
- Klasy aminokwasów:
- 1. Alifatyczne
- 2. Siarkowe
- 3. Aromatyczne
- 4. Obojętne (z grupą OH)
- 5. Kwasowe
- 6. Zasadowe
- 7. Prolina
W zależności od położenia grupy aminowej, można wyróżnić α, β, γ, δ i ε-aminokwasy, gdzie litera grecka określa odległość pomiędzy grupą aminową, a karboksylową. W α-aminokwasach obie te grupy funkcyjne przyłączone są do tego samego atomu węgla.
Ze względu na liczbę grup aminowych i karboksylowych wyróżnia się aminokwasy:
- obojętne – gdy jest tyle samo (zwykle po jednej) grup aminowych i karboksylowych
- kwasowe – gdy przeważa liczba grup karboksylowych
- zasadowe – gdy przeważa liczba grup aminowych
[edytuj] Aminokwasy naturalne
Znanych jest ponad 300 aminokwasów występujących naturalnie. W skład białek wszystkich organizmów żywych wchodzą głównie 20 podstawowe aminokwasy (aminokwasy biogenne lub białkowe), które są α-aminokwasami szeregu L, a także niewielkie ilości wielu innych, w większości będących pochodnymi aminokwasów podstawowych. Są podstawowymi jednostkami budulcowymi peptydów i białek. Zazwyczaj są rozpuszczalne w wodzie i w warunkach fizjologicznego pH są zjonizowane.
α-Aminokwasy na atomie węgla α mogą posiadać resztę biogenną (R), która może zawierać pierścień aromatyczny, łańcuch alifatyczny, siarkę, grupę wodorotlenową, dodatkową grupę aminową bądź karboksylową. Atom węgla α takich aminokwasów jest atomem chiralnym, co oznacza, że każdy aminokwas może występować w dwóch konfiguracjach przestrzennych, oznaczanych zwyczajowo jako D i L.
Występowanie tych aminokwasów i ich ułożenie w łańcuchu polipeptydowym (sekwencja) zależy od kodu genetycznego zapisanego w DNA. Kolejne reszty aminokwasowe w łańcuchu polipeptydowym połączone są ze sobą za pomocą wiązania peptydowego.
| Skrót | Pełna nazwa | Typ aminokwasu | Masa cz.(**) | Punkt izoel. | Schemat | Wzór strukruralny | Uwagi | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A | Ala | Alanina | obojętny hydrofobowy alifatyczny | 71,0788 | 6,11 | |||
| C | Cys | Cysteina | obojętny hydrofobowy aminokwas siarkowy | 103,1388 | 5,05 | Dwie cysteiny mogą utworzyć mostek dwusiarczkowy tworząc tzw. cystynę | ||
| D | Asp | Kwas asparaginowy | kwaśny | 115,0886 | 2,85 | |||
| E | Glu | Kwas glutaminowy | kwaśny | 129,1155 | 3,15 | |||
| F | Phe | Fenyloalanina (*) | obojętny hydrofobowy aromatyczny | 147,1766 | 5,49 | |||
| G | Gly | Glicyna | obojętny hydrofobowy | 57,0519 | 6,06 | Ponieważ przy węglu α znajdują się dwa atomy wodoru, glicyna nie jest optycznie czynna. | ||
| H | His | Histydyna (*) | zasadowy | 137,1411 | 7,60 | |||
| I | Ile | Izoleucyna (*) | obojętny hydrofobowy alifatyczny | 113,1594 | 6,05 | |||
| K | Lys | Lizyna (*) | zasadowy | 128,1741 | 9,60 | |||
| L | Leu | Leucyna (*) | obojętny hydrofobowy alifatyczny | 113,1594 | 6,01 | |||
| M | Met | Metionina (*) | obojętny hydrofobowy | 131,1926 | 5,74 | zawiera siarkę | ||
| N | Asn | Asparagina (Amid kwasu asparaginowego) |
hydrofilowy | 114,1038 | 5,41 | |||
| P | Pro | Prolina | hydrofobowy heterocykliczny | 97,1167 | 6,30 | Może zakłócać takie struktury białka jak helisa alfa i harmonijka beta. Od innych aminokwasów odróżnia się brakiem pierwszorzędowej grupy aminowej. | ||
| Q | Gln | Glutamina (Amid kwasu glutaminowego) |
hydrofilowy | 128,1307 | 5,65 | |||
| R | Arg | Arginina | zasadowy | 156,1875 | 10,76 | |||
| S | Ser | Seryna | obojętny hydrofilowy hydroksyaminokwas | 87,0782 | 5,68 | |||
| T | Thr | Treonina (*) | obojętny hydrofilowy hydroksyaminokwas | 101,1051 | 5,60 | |||
| V | Val | Walina (*) | obojętny hydrofobowy alifatyczny | 99,1326 | 6,00 | |||
| W | Trp | Tryptofan (*) | obojętny hydrofobowy aromatyczny i heterocykliczny | 186,2132 | 5,89 | |||
| Y | Tyr | Tyrozyna | obojętny słabo hydrofobowy | 163,1760 | 5,64 | |||
Legenda
- (*) aminokwasy egzogenne; pozostałe to aminokwasy endogenne
- (**) w środowisku wodnym do masy aminokwasu należy doliczyć masę 1 cz. wody
[edytuj] Zobacz też
[edytuj] Linki zewnętrzne
Alanina • Arginina • Asparagina • Kwas asparaginowy • Cysteina • Kwas glutaminowy • Glutamina • Glicyna • Histydyna • Izoleucyna • Leucyna • Lizyna • Metionina • Fenyloalanina • Prolina • Seryna • Treonina • Tryptofan • Tyrozyna • Walina
|
|
brak hosta wymiana linkow 906 no host brak hosta