Aminokwasy - Nauka

Aminokwasy

Z Wikipedii

Skocz do: nawigacji, szukaj
Schemat budowy aminokwasu – grupa aminowa po lewej i karboksylowa po prawej

Aminokwasy – organiczne związki chemiczne, zawierające grupę aminową -NH2 (zasadową) oraz grupę karboksylową -COOH (kwasową) lub – w ujęciu ogólniejszym – dowolną grupę kwasową, np. sulfonową. W roztworach aminokwasy występują jako tzw. sole wewnętrzne (amfolity). Niezwykle ważnym kryterium aminokwasów jest więc punkt izoelektryczny (pI)

Spis treści

[edytuj] Kryteria podziału aminokwasów

Istnieje wiele kryteriów podziału aminokwasów:

  • Rodzaj rodnika (łańcuchowe, pierścieniowe)
  • Polarność rodnika (polarny, niepolarny)
  • Miejsce syntezy (endogenne, egzogenne)
  • Położenie grupy aminowej względem karboksylowej (α, β, γ, δ i ε-aminokwasy)
  • Przemiany szkieletów:
    • Glikogenne (dostarczają pirogronianu)
    • Ketogenne (dostarczają Acetylo-CoA)
    • Glikoketogenne
  • Występowanie w białkach (proteogenne, nieproteogenne)
  • Klasy aminokwasów:
    • 1. Alifatyczne
    • 2. Siarkowe
    • 3. Aromatyczne
    • 4. Obojętne (z grupą OH)
    • 5. Kwasowe
    • 6. Zasadowe
    • 7. Prolina

W zależności od położenia grupy aminowej, można wyróżnić α, β, γ, δ i ε-aminokwasy, gdzie litera grecka określa odległość pomiędzy grupą aminową, a karboksylową. W α-aminokwasach obie te grupy funkcyjne przyłączone są do tego samego atomu węgla.

Ze względu na liczbę grup aminowych i karboksylowych wyróżnia się aminokwasy:

  • obojętne – gdy jest tyle samo (zwykle po jednej) grup aminowych i karboksylowych
  • kwasowe – gdy przeważa liczba grup karboksylowych
  • zasadowe – gdy przeważa liczba grup aminowych
Kondensacja aminokwasów – tworzenie wiązania peptydowego

[edytuj] Aminokwasy naturalne

Znanych jest ponad 300 aminokwasów występujących naturalnie. W skład białek wszystkich organizmów żywych wchodzą głównie 20 podstawowe aminokwasy (aminokwasy biogenne lub białkowe), które są α-aminokwasami szeregu L, a także niewielkie ilości wielu innych, w większości będących pochodnymi aminokwasów podstawowych. Są podstawowymi jednostkami budulcowymi peptydów i białek. Zazwyczaj są rozpuszczalne w wodzie i w warunkach fizjologicznego pH są zjonizowane.

α-Aminokwasy na atomie węgla α mogą posiadać resztę biogenną (R), która może zawierać pierścień aromatyczny, łańcuch alifatyczny, siarkę, grupę wodorotlenową, dodatkową grupę aminową bądź karboksylową. Atom węgla α takich aminokwasów jest atomem chiralnym, co oznacza, że każdy aminokwas może występować w dwóch konfiguracjach przestrzennych, oznaczanych zwyczajowo jako D i L.

Peptydy to łańcuchy reszt aminokwasowych

Występowanie tych aminokwasów i ich ułożenie w łańcuchu polipeptydowym (sekwencja) zależy od kodu genetycznego zapisanego w DNA. Kolejne reszty aminokwasowe w łańcuchu polipeptydowym połączone są ze sobą za pomocą wiązania peptydowego.

Skrót Pełna nazwa Typ aminokwasu Masa cz.(**) Punkt izoel. Schemat Wzór strukruralny Uwagi
A Ala Alanina obojętny hydrofobowy alifatyczny 71,0788 6,11 Grafika:Alanina-model3d THUMB.PNG
C Cys Cysteina obojętny hydrofobowy aminokwas siarkowy 103,1388 5,05 Grafika:Cysteina-model3d THUMB.PNG Dwie cysteiny mogą utworzyć mostek dwusiarczkowy tworząc tzw. cystynę
D Asp Kwas asparaginowy kwaśny 115,0886 2,85 Grafika:Kwas asparaginowy-model3d THUMB.PNG
E Glu Kwas glutaminowy kwaśny 129,1155 3,15 Grafika:Kwas glutaminowy-model3d THUMB.PNG
F Phe Fenyloalanina (*) obojętny hydrofobowy aromatyczny 147,1766 5,49 Grafika:Fenyloalanina-model3d THUMB.PNG
G Gly Glicyna obojętny hydrofobowy 57,0519 6,06 Grafika:Glicyna-model3d THUMB.PNG Ponieważ przy węglu α znajdują się dwa atomy wodoru, glicyna nie jest optycznie czynna.
H His Histydyna (*) zasadowy 137,1411 7,60 Grafika:Histydyna-model3d THUMB.PNG
I Ile Izoleucyna (*) obojętny hydrofobowy alifatyczny 113,1594 6,05 Grafika:Izoleucyna-model3d THUMB.PNG
K Lys Lizyna (*) zasadowy 128,1741 9,60 Grafika:Lizyna-model3d THUMB.PNG
L Leu Leucyna (*) obojętny hydrofobowy alifatyczny 113,1594 6,01 Grafika:Leucyna-model3d THUMB.PNG
M Met Metionina (*) obojętny hydrofobowy 131,1926 5,74 Grafika:Metionina-model3d THUMB.PNG zawiera siarkę
N Asn Asparagina
(Amid kwasu asparaginowego)
hydrofilowy 114,1038 5,41 Grafika:Asparagina-model3d THUMB.PNG
P Pro Prolina hydrofobowy heterocykliczny 97,1167 6,30 Grafika:Prolina-model3d THUMB.PNG Może zakłócać takie struktury białka jak helisa alfa i harmonijka beta. Od innych aminokwasów odróżnia się brakiem pierwszorzędowej grupy aminowej.
Q Gln Glutamina
(Amid kwasu glutaminowego)
hydrofilowy 128,1307 5,65 Grafika:Glutamina-model3d THUMB.PNG
R Arg Arginina zasadowy 156,1875 10,76 Grafika:Arginina-model3d THUMB.PNG
S Ser Seryna obojętny hydrofilowy hydroksyaminokwas 87,0782 5,68 Grafika:Seryna-model3d THUMB.PNG
T Thr Treonina (*) obojętny hydrofilowy hydroksyaminokwas 101,1051 5,60 Grafika:Treonina-model3d THUMB.PNG
V Val Walina (*) obojętny hydrofobowy alifatyczny 99,1326 6,00 Grafika:Walina-model3d THUMB.PNG
W Trp Tryptofan (*) obojętny hydrofobowy aromatyczny i heterocykliczny 186,2132 5,89 Grafika:Tryptofan-model3d THUMB.PNG
Y Tyr Tyrozyna obojętny słabo hydrofobowy 163,1760 5,64 Grafika:Tyrozyna-model3d THUMB.PNG

Legenda

(*) aminokwasy egzogenne; pozostałe to aminokwasy endogenne
(**) w środowisku wodnym do masy aminokwasu należy doliczyć masę 1 cz. wody

[edytuj] Zobacz też

[edytuj] Linki zewnętrzne








brak hosta wymiana linkow 906 no host brak hosta